การจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อ Vibrio parahaemolyticus ที่แยกได้จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วยด้วยการวิเคราะห์ variable number of tandem repeat (VNTR)

Abstract

เชื้อ Vibrio parahaemolyticus เป็นแบคทีเรียแกรมลบที่เป็นสาเหตุของโรคอาหารเป็นพิษ และโรคกระเพาะอาหารและลำไส้อักเสบในคน การติดเชื้อเกิดจากการรับประทานอาหารทะเลดิบหรือปรุงไม่สุก การแยกสายพันธุ์ของเชื้อมีประโยชน์ทางด้านระบาดวิทยา และการควบคุมการแพร่ระบาดของเชื้อ การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อ V. parahaemolyticus ที่แยกได้จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วย จำนวน 30 ไอโซเลต ด้วยการวิเคราะห์ variable number of tandem repeat (VNTR) โดยทำการเลือก tandem repeat มา 2 ตำแหน่ง ผลการศึกษาพบว่า การวิเคราะห์ VNTR ตำแหน่งที่หนึ่งสามารถจำแนกเชื้อได้ 3 สายพันธุ์ ได้แก่ VN1-1, VN1-2 และ VN1-3 โดยเชื้อส่วนใหญ่ถูกจัดอยู่ในสายพันธุ์ VN1-1 คิดเป็นร้อยละ 86.7 (26/30) และไม่สามารถจำแนกสายพันธุ์ได้ 1 ไอโซเลต VNTR ตำแหน่งที่สองสามารถจำแนกเชื้อได้ 2 สายพันธุ์ ได้แก่ VN2- 1 และ VN2-2 และไม่สามารถจำแนกสายพันธุ์ได้ 7 ไอโซเลต และเมื่อนำมาประเมินความสามารถในการแยกสายพันธุ์ พบว่า ค่า discriminatory index ของ VNTR ทั้งสองตำแหน่ง มีค่าเท่ากับ 0.2 และ 0.09 ตามลำดับ แสดงให้เห็นว่า tandem repeat ตำแหน่งแรกมีความสามารถในการจำแนกสายพันธุ์ดีกว่าตำแหน่งที่สอง ผลที่ได้จากการศึกษานี้สามารถนำไปเป็นข้อมูลในการจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อ V. parahaemolyticus ได้ในอนาคต

Vibrio parahaemolyticus, a gram-negative bacterium, is a causative agent of food poisoning and gastroenteritis in human. Infection is associated with consumption of raw or undercooked seafood. Molecular typing is useful for epidemiology study and control the spread of this bacterium. The objective of this study is to type 30 isolates of V. parahaemolyticus isolated from patient specimens by variable number of tandem repeat (VNTR) analysis. Tandem repeats from two loci were selected. The results demonstrated that the first loci could classify V. parahaemolyticus into 3 strains; VN1-1, VN1-2 and VN1-3. Most isolates were classified into VN1-1 strain with 86.7 % (26/30), and there were 1 isolates that could not be classified (untypable). The second loci could discriminate V. parahaemolyticus into 2 strains; VN2-1 and VN2-2 and there were 7 isolates that could not be classified (untypable). When the typing ability of two loci was evaluated, the results revealed that the discriminatory index of two VNTR loci were 0.2 and 0.09, respectively. This suggested that the first loci had more discriminatory ability than the second one. Results from this study could be used as the data for molecular typing of V. parahaemolyticus in the future.