การจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อ Vibrio parahaemolyticus ที่แยกได้จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วยด้วยวิธี arbitrarily-primed PCR (AP-PCR) เปรียบเที่ยบกับการวิเคราะห์ variable number of tandem repeat (VNTR)

Abstract

การศึกษานี้มีวัตถุประสงค์เพื่อจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อ Vibrio parahaemolyticus ซึ่งเป็นแบคทีเรียก่อโรคทางเดินอาหารอักเสบและอาหารเป็นพิษ จำนวน 30 ไอโซเลต (Isolates) ที่แยกได้จากสิ่งส่งตรวจของผู้ป่วย โดยเปรียบเทียบระหว่างวิธี Arbitrarily-primed PCR (AP-PCR) กับการวิเคราะห์ Variable Number of Tandem Repeat (VNTR) ผลการศึกษาพบว่า วิธี AP-PCR โดยใช้ AP-primer 2 สามารถจำแนกสายพันธุ์ของเชื้อได้เป็น 10 รูปแบบ ในขณะที่การวิเคระห์ VNTR ทั้งสองตำแหน่งสามารถจำแนกเชื้อได้เพียง 1 รูปแบบ นอกจากนี้ค่า Discriminatory Index ของวิธี AP-PCR และการวิเคราะห์ VNTR ทั้งสองตำแหน่ง มีค่าเท่ากับ 0.87, 0 และ 0.07 ตามลำดับ แสดงให้เห็นว่าในการศึกษานี้วิธี AP-PCR นั้นมีความสามารถในการจำแนกสายพันธุ์สูงกว่าการวิเคราะห์ VNTR ผลที่ได้นี้สามารถนำไปพัฒนาหาวิธีจำแนกสายพันธุ์เชื้อ V. parahaemolyticus ได้ต่อไป

Vibrio parahaemolyticus is a bacterium that causes gastroenteritis and food poisoning. The objective of this study is to type 30 isolated of V. parahaemolyticus isolated from patient specimens by comparing between arbitrarily-primed PCR (AP-PCR) method and variable number of tandem repeat (VNTR) analysis. The results demonstrated that AP-PCR method using AP-primer 2 could discriminate to 10 types whereas, VNTR analysis of both loci could discriminate only one type. In addition, the discriminatory index of AP-PCR and two VNTR loci were 0.87, 0 and 0.07, respectively. This suggested that AP-PCR method had more discriminatory ability than VNTR analysis. These results could be used to develop methods for V. parahaemolyticus typing in the future.